2006年，位于高明古耶贝丘遗址引起了一位美国科学院院士的极大关注，他认为遗址的保存完好的水下木制品更是同类独有，值得拓展研究。

据《广州日报》报导，考古专家已经从沉睡的古耶贝丘遗址发掘出数百件宝贝级石器，包括砍砸器、刮削器、石斧、石锛、石凿、砾石、石镞……每一件石制工具都闪耀着古耶人原始的生活气息。编号为「1号」的石锛，长约4.5厘米，宽为4.1厘米，通体为乳白色，其上部有一个柄状的突出部，下面为四方形石块，该石器两面已被磨平，中间有尖刃。据广东省考古队尚工介绍，该石锛已经在地下埋了6000多年了，他解释说：「远古时代，人们生产工具落后，没有金属制品，石锛是用来挖东西或者削刮用的，比如说对食物的外皮进行处理等等」。

奇怪的是，国内外专家研究表明：所有出土的石器的原石竟然全部来自西樵山。

据崔勇介绍，在珠三角地区，只有西樵山才拥有这样的火山岩石头，到目前为止，他们发现所有的石器均来自西樵山。

专家向记者描述了这样的一幅场景：6000年前，古耶到西樵是一望无际的大海，远古先祖们划着独木舟，来到西樵山采石，磨制成工具后加工木器。由于年代太久远，所有的木制器具已经腐烂，只剩下这众多的石器，令后人对他们的生活充满无限的遐想。

该遗址还发现了两个价值不菲的四耳彩色陶罐。

高明古耶贝丘遗址为「2006年度全国十大考古新发现」之一，距今约4500年，是目前发现最为完整，最为典型的贝丘遗址。

可是，具有重大历史价值的高明古耶贝丘遗址由于广明高速公路路线规划必经古耶贝丘，荷城街道荷富加油站至古耶村贝丘遗址附近区域被列入征地范围。高明区博物馆相关负责人介绍说，为使珍贵的古遗址不被破坏，省考古研究所近期将与广明高速公路施工单位，就古耶贝丘遗址的挖掘项目及挖掘面积签订相关合同。

为合理利用和保护高明古耶贝丘遗址，保护区拟用5年的时间将其打造成为湿地公园，并重新对外展示。